办公室：
      负责人事劳资、文件档案、统计报表、考评总结、宣传党务、会务接待、车辆管理、职工考勤和报刊收发等方面的工作；负责人事代理、临时工、借用人员、挂编人员和离退休人员的管理工作；负责职工社保、住房补贴、抚恤和丧葬等方面的工作。
    主任：徐京鹏　　副主任：张鸣虹　　联系电话：0791-88332722     传真：0791-88332722

业务办：
     负责检测业务拓展、联系、咨询、受理和布置工作；负责检测委托书和检测任务单的填写工作；负责外出抽取检测样品工作（必要时由其它部门人员参与）；负责检测报告打印、盖章、签发、邮寄、收费管理、检测样品传送和受理客户投诉等方面的工作。 
    主任：万春花　　副主任：王　凯　　联系电话：0791-88322532/88334720     传真：0791-88302703

财务室：
     负责全所财务管理工作；负责医保基金、社保基金、住房公积金、固定资产和各部门收支统计报表等方面的工作。
    主任：卢　强　　副主任：左美玲　　 联系电话：0791-88334756

质管办：
    负责检测工作质量管理体系的建立和监督检查工作；负责检测资质认证认可工作；负责客户投诉处理工作，负责实验室能力比对、标准物质、记录档案、标准资料和贵重物品管理工作；负责仪器设备的计量检定和校准管理工作；负责组织实施实验室信息管理系统（LIMS）等方面的工作。
    主任：易　永　　联系电话：0791-88316050

基建办：
     负责江西科技创新大厦的建设工作；负责房屋、水电、电梯、仪器设备、电脑、视频监控、信息网络设备和网站的维护维修等方面的工作。
    主任：王　璟　　副主任：黄庆和　　联系电话：0791-88307094

综合办：
     负责办公园区房屋租赁、企业管理、安全保卫、环境卫生和办公园区车辆管理等方面的工作；负责科技型中小微企业的引进、管理和服务工作；负责社会管理综合治理、节能和消防等方面的工作；负责江西省大型科学仪器协作共用网和分析测试协会的日常工作；协助科技厅条财处承担进口仪器审核及免税审核工作；承担本单位仪器设备政府采购等方面的工作。   
    主任：李　翔　　 联系电话：0791-88316173/88340629

生物医药分析室：
     承担食品、医药和饲料等方面的检测工作，配合业务办，开展业务拓展、联系和咨询工作，负责本部门检测报告录入、编辑和审核工作；负责本部门质量管理工作，负责本部门仪器设备、试剂材料的管理使用和采购工作，负责本部门检测样品制备、实验室用水和样品管理工作，负责本部门办公室和实验室安全卫生等方面的工作。
    主任：罗　香　　副主任：胡海山　 黄优生　　联系电话：0791-88331971/88121091

 
资源环境分析室：
     承担金属、化工和环境等方面的检测工作，配合业务办，开展业务拓展、联系和咨询工作，负责本部门检测报告录入、编辑和审核工作；负责本部门质量管理工作，负责本部门仪器设备、试剂材料的管理使用和采购工作，负责本部门检测样品制备、实验室用水和样品管理工作，负责本部门办公室和实验室安全卫生等方面的工作。
    主任：童迎东　　副主任：刘永林　　联系电话：0791-88333761/88121090

研究室：
     承担科研课题研究及科研管理等方面的工作。
    副主任：范　莹　　联系电话：0791-88331217